Oxford Nanopore und Day Zero Diagnostics haben eine Zusammenarbeit zur Entwicklung einer End-to-End-Lösung für die Diagnose von Infektionen der Blutbahn, einer der häufigsten Ursachen für Sepsis, angekündigt. Die Unternehmen werden gemeinsam an der Integration und Optimierung eines Diagnosesystems für den Einsatz in klinischen Einrichtungen wie Krankenhäusern arbeiten, das eine Identifizierung am selben Tag und eine genombasierte Erstellung von Antibiotika-Empfindlichkeitsprofilen ermöglicht, ohne dass eine Blutkultur erforderlich ist. Die Unternehmen planen, in Zukunft die behördlichen Zulassungen anzustreben, auch bei der FDA.

Nach Angaben der Weltgesundheitsorganisation (WHO) gibt es jedes Jahr 11 Millionen sepsisbedingte Todesfälle, was einem von fünf Todesfällen weltweit entspricht. Eine frühzeitige und wirksame Behandlung ist bei einer schweren Infektion von entscheidender Bedeutung, da das Sterberisiko stündlich steigen kann. Bei der derzeitigen kulturbasierten Diagnostik kann es jedoch Tage dauern, bis ein Ergebnis vorliegt, auch bei der Empfindlichkeit gegenüber antimikrobiellen Substanzen.

Lange Bearbeitungszeiten haben auch die Rolle der Diagnostik bei der Standardtherapie stark eingeschränkt, was sowohl zu einer schädlichen Überbehandlung als auch zu einer tödlichen Unterbehandlung führt, wenn es sich um antibiotikaresistente Organismen handelt. Es besteht ein dringender Bedarf an Schnelldiagnostik, die sowohl die Identifizierung von Organismen als auch die Ergebnisse von Empfindlichkeitstests für antimikrobielle Mittel innerhalb von Stunden liefern kann, um die Therapie zu steuern. Das Diagnosesystem wird die ultrahochangereicherte Probenvorbereitungstechnologie von DZD und die KI-gesteuerte Keynome-Pipeline zur Identifizierung von Mikroorganismen und Antibiotikaempfindlichkeit mit den Sequenzierdaten des kleinformatigen PromethION 2 Solo von Oxford Nanopore kombinieren, der einen hohen Durchsatz aufweist.

Die Zusammenarbeit zielt auf einen vollautomatischen Arbeitsablauf für die Probenverarbeitung und Sequenzierung ab, der den Anforderungen klinischer Krankenhauslabore entspricht. Die einzigartigen, skalierbaren Echtzeit-Funktionen und die Fortschritte bei der Genauigkeit der Einzel-Nukleotid-Sequenzierung der Oxford Nanopore-Plattform machen sie ideal für die schnelle und kostengünstige Charakterisierung von Krankheitserregern in klinischen Proben. Neben der Zusammenarbeit bei den Diagnosesystemen hat DZD auch eine Vereinbarung unterzeichnet, um ONT-basierte Sequenzierung und Analyse für kommerzielle Kunden anzubieten.

DZD bietet derzeit unter der Marke epiXact eine Reihe von Labordienstleistungen an, die auf proprietären Technologien beruhen und Unternehmen im Gesundheitswesen und in der Biowissenschaft dabei helfen, Infektionsausbrüche zu verfolgen und zu bewältigen, Organismen zu charakterisieren, die für Forschungszwecke von Interesse sind, und wichtige Entscheidungen in Forschung und Entwicklung zu treffen. ONT wird nun eine Sequenzierungsplattform sein, auf der diese Dienstleistungen erbracht werden können. DZD hat vor kurzem die Einführung von epiXact ID angekündigt, einem schnellen Service, der eine hochauflösende Identifizierung von Organismen und eine tiefgehende Charakterisierung einer Probe mit Hilfe der Nanopore-Ganzgenomsequenzierung ermöglicht.