Olink Holding AB (publ) berichtet über die Veröffentlichung von drei Artikeln in der renommierten Fachzeitschrift Nature, die die Leistungsfähigkeit der Olink Explore Plattform für aussagekräftige proteogenomische Studien im Bevölkerungsmaßstab demonstrieren. Für die Studien wurden jeweils Daten aus dem UK Biobank Pharma Proteomics Project (UKB-PPP) verwendet, in dessen Rahmen 13 pharmazeutische Unternehmen durch den Zugriff auf die UK Biobank neue proteomische Daten generierten. Mit Hilfe der Olink Explore Plattform haben die Forscher rund 3.000 Proteine in mehr als 54.000 Proben von UKB-Teilnehmern gemessen.

Durch die Kombination von Genom- und Proteomanalysen in einem noch nie dagewesenen Umfang steht eine Fülle neuer Informationen über die genetischen Auswirkungen auf die Proteinexpression und phänotypische Ergebnisse zur Verfügung. Die Ergebnisse verdeutlichen den immensen Wert der Proteogenomik für die Aufklärung biologischer Mechanismen, die Identifizierung neuer Biomarker und die Beschleunigung der Arzneimittelentwicklung. Die Arbeit von Sun et al.

des UKB-PPP-Konsortiums liefert die erste detaillierte Zusammenfassung der Daten, begleitet von nachgelagerten GWAS-basierten proteogenomischen Analysen, Protein Quantitative Trait Loci (pQTL) Mapping, Krankheitsassoziationen im Querschnitt und proteomischen Vorhersagen von demographischen Faktoren und physiologischen Funktionen. Durch die Aufdeckung von mehr als 14.000 genetischen Assoziationen mit Proteinexpressionsniveaus, von denen 81 % neu sind, zeigen die Ergebnisse dieser bahnbrechenden Arbeit deutlich die Bedeutung von Hochdurchsatz-Proteinmessungen für die Identifizierung wichtiger biologischer Pfade und deren Auswirkungen auf die Gesundheit. In einer zweiten Arbeit von Dhindsa et al., die hauptsächlich von Konsortiumsmitgliedern von AstraZeneca verfasst wurde, wurde der in der Arbeit beschriebene Datensatz verwendet, um genetische Assoziationen von seltenen proteinkodierenden Varianten mit der Proteinexpression zu untersuchen.

Die Ergebnisse werfen ein Licht auf die entscheidende Rolle seltener Varianten bei der Variation des Plasmaproteinspiegels und der biologischen Ergebnisse und unterstreichen die Notwendigkeit groß angelegter proteogenomischer Studien, um solche Entdeckungen zu ermöglichen. Der dritte Artikel von Eldjarn et al. beschreibt eine Studie, in der die von Olink generierten Ergebnisse im UKB-PPP-Datensatz mit der proteogenomischen Analyse einer großen isländischen Bevölkerungskohorte unter Verwendung einer Aptamer-basierten Technologie verglichen wurden.

Während beide Plattformen eine große Anzahl genetischer Assoziationen mit den Proteinkonzentrationen identifizierten, war ein signifikant höherer Anteil der mit Olink gemessenen Proteine (72% gegenüber 43% bei Verwendung der Aptamer-basierten Technologie) mit cis-pQTLs assoziiert, was eine starke genetische Bestätigung für die überlegene Spezifität der Olink-Assays darstellt. Darüber hinaus waren die medianen CV-Verhältnisse bei den Olink-Assays geringer, was darauf hindeutet, dass sie im Durchschnitt präziser waren.