Die Zusammenstöße fanden am Montag in dem ländlichen Bezirk Mangina in der Nähe von Beni statt, wie die Armee am Dienstag mitteilte.
Die Sicherheitslage hatte sich dort seit letztem Monat verschlechtert, als ein Mitglied der Provinzversammlung junge Menschen dazu ermutigte, zu den Waffen zu greifen und eine kleine Miliz zu bilden, um sich der Armee entgegenzustellen, so die Erklärung des örtlichen Armeesprechers Antony Mwalushayi.
Der in der Erklärung genannte Parlamentarier, Alain Siwako, bestritt dies. Er sagte Reuters telefonisch, dass die Kämpfer der Miliz nicht aus Mangina stammten und dass der Armeesprecher ihn aus persönlichen Gründen beschuldigt habe.
Am Montag wurden Soldaten auf Patrouille von den jungen Milizionären in einen Hinterhalt gelockt und eröffneten bei den anschließenden Zusammenstößen das Feuer auf Zivilisten, so die Erklärung der Armee.
Ein Reuters-Reporter zählte am Dienstag sieben Leichen von Zivilisten in der Stadt. Ein Einwohner sagte, sein Nachbar sei auf dem Weg gewesen, sein Haus zu sichern, bevor er floh, als er erschossen wurde.
"Er war Vater von zwei Kindern und starb mit dem Vorhängeschloss in der Hand", sagte der 56-jährige Kahindo Mbahikya, der die Angriffe überlebt hatte.
Die sechs Soldaten, die verhaftet wurden, "werden von der Armee der Exzesse und der angeblichen Ermordung von 4 Zivilisten beschuldigt", so die Erklärung der Armee.
Im Ostkongo gibt es Dutzende von Milizen, von denen einige noch aus dem Bürgerkrieg von 1998-2003 stammen.
Seit der Wiederwahl von Präsident Felix Tshisekedi in einer umstrittenen Wahl im letzten Monat sind die Spannungen im ganzen Land hoch.
