Die Armee des westafrikanischen Landes ordnete diese Woche an, dass die Zivilbevölkerung zwei große "militärische Interessenzonen" zu ihrem Schutz verlassen soll, gab aber nicht an, wie lange sie evakuiert werden müssen oder wohin sie gehen sollen.
Eine der Militärzonen ist ein ländliches Gebiet von etwa 2.000 Quadratkilometern (772 Quadratmeilen) an der Grenze zu Mali in der nördlichen Provinz Soum.
Die andere umfasst etwa 11.000 Quadratkilometer an der südlichen Grenze zu Benin und ist größtenteils Nationalparkland.
Reuters war nicht in der Lage festzustellen, wie viele Menschen in diesen Gebieten leben.
"Die Bevölkerung hat 14 Tage Zeit, um sich in die sicheren Zonen zu begeben", sagte Armeesprecher Yves Didier Bamouni bei einer Pressekonferenz.
"Es ist sehr wichtig, Freunde von Feinden unterscheiden zu können", sagte er, ohne weitere Details zu nennen.
Aus Militärkreisen erfuhr Reuters, dass die Regierung den Vertriebenen Unterstützung gewähren werde.
Die Regierung reagierte nicht sofort auf Anfragen.
Burkina Faso kämpft seit 2015 gegen militante Islamisten, die in der Region aktiv sind und zum Teil Verbindungen zu Al-Qaida und dem Islamischen Staat haben.
Die Kämpfe haben allein in Burkina Faso mehr als 1,85 Millionen Menschen vertrieben und Tausende von Menschen in der Sahelzone getötet.
Die Evakuierung wurde angeordnet, nachdem bei einem großen Angriff im Norden am 11. Juni mindestens 100 Zivilisten getötet und Tausende weitere vertrieben worden waren.
Die Armee kündigte am Freitag auch ein dreimonatiges Verbot für bestimmte Marken von Motorrädern und motorisierten Dreirädern in Teilen von acht Regionen an.
Das Verbot soll der Armee helfen, Zivilisten von Kämpfern zu unterscheiden, die dafür bekannt sind, dass sie auf Motorrädern reisen und Anschläge verüben.
Es wurden keine Details oder ein Zeitplan für die bevorstehenden Militäreinsätze bekannt gegeben.
