Das Kraftwerk wird von dem russischen Staatskonzern Rosatom für 30 Milliarden Dollar gebaut und wird aus vier Blöcken mit einer Gesamtkapazität von 4,8 Gigawatt bestehen.
Die beiden Präsidenten eröffneten den Bau des vierten und letzten Blocks, wie staatliche ägyptische Medien berichteten.
"Die Zusammenarbeit zwischen unseren beiden Ländern geht weiter und entwickelt sich. Ägypten ist ein enger Freund von uns und ein strategischer Partner", sagte Putin.
Ägypten, das mit einer Bevölkerung von 105 Millionen Einwohnern einen steigenden Strombedarf hat, versucht, sich als regionales Energiezentrum zu positionieren, das Strom in die Nachbarländer exportiert, und seine Energiequellen zu diversifizieren.
Seit Sisi 2014 Präsident wurde, hat das Land Überkapazitäten in der Stromerzeugung aufgebaut, kämpft aber seit letztem Sommer mit Stromausfällen, nachdem Hitzewellen die Nachfrage nach Kühlung in die Höhe getrieben hatten.
Die Produktion von Erdgas, das für die Stromerzeugung verwendet wird, ist ebenfalls zurückgegangen, und Ägypten hat in einigen Kraftwerken auf die Verbrennung von umweltschädlicherem Heizöl zurückgegriffen, um die LNG-Exporte - eine wichtige Quelle für knappe Devisen - aufrechtzuerhalten.
"Die Einführung der Kernenergie in den Energiemix ist entscheidend, um die wachsende Nachfrage nach elektrischer Energie zu decken", sagte Sisi.
Moskau und Kairo haben 2015 ein Abkommen über den Bau eines Kernkraftwerks in Ägypten unterzeichnet, wobei Russland Ägypten ein Darlehen zur Deckung der Baukosten gewährt hat.
Andernorts hilft Russland bei der Umsetzung von Projekten zum Bau des Kudankulam-Kernkraftwerks im südindischen Bundesstaat Tamil Nadu sowie des Kernkraftwerks Paks in Ungarn und des ersten Kernkraftwerks der Türkei in Akkuyu.
Der staatliche russische Atomkonzern Rosatom ist auch in China und Bangladesch tätig.
